Die Geschlechtsbestimmung bei den Diepholzergänsen ist nicht immer einfach, besonders bei jüngeren Tieren, die noch nicht ganz ausgewachsen sind. Erschwerend kommt dazu, dass in Aufzuchtgruppen schwächere Ganter oft unterdrückt werden und deren Demutshaltung dazu führt, dass man sie dem weiblichen Geschlecht zuordnet. Am sichersten lässt sich das Geschlecht an der Kloake feststellen, wobei dies bei geschlechtsreifen Alttieren einfacher ist, als bei Jungtieren. Gerade bei halbjährigen
Gantern ist der Penis noch klein und kann übersehen werden.
In seltenen Fällen kann der Penis eines Ganters, der noch nie in der Zucht eingesetzt wurde, verklebt sein und dadurch nicht ausgefahren werden. Mit etwas Druck lässt er sich meist ausstülpen und ist dann fortan einsatzfähig. Bei Zuchtpaaren, die trotz Begattungen unbefruchtete Eier legen, kann die Kontrolle, ob der Penis überhaupt ausfahren kann, die Lösung bringen.
Die Untersuchung der Kloake erfolgt sitzend. Sitzt man tief oder stellt man seine Füsse auf eine Erhöhung, bilden die schräg nach oben zu den Knien laufenden Oberschenkel eine ideale Mulde, um das zu untersuchende Tier zu platzieren. Dabei wird die Gans so zwischen die Beine geklemmt, dass der Hals der Gans nach unten und deren Bauch zum Bauch des Untersuchenden schaut. Dieser kann mit seinen Unterarmen die Läufe der Gans fixieren und mit den Händen die Kloake untersuchen.
Ist die Gans so fixiert, kann mit Daumen- und Zeigefinger beider Hände durch schräges, seitlich nach unten gerichtetes Ziehen die Kloake ausgestülpt werden. Dabei ist vorsichtig vorzugehen, um den Penis nicht zu verletzen, was dazu führen kann, dass der Ganter nicht mehr zur Kopulation fähig ist. Laien wird daher empfohlen, sich das richtige Handling von einem erfahrenen Züchter zeigen zu lassen.